מבני התחנה ההידראולית נבדלים בעיקר על ידי מבנה יחידת המשאבה, מיקום ההתקנה ושיטת הקירור. באופן ספציפי, ניתן לסווג אותם לסוגים הבאים:
1) עליון - תחנה הידראולית אנכית רכובה: יחידת המשאבה מותקנת אנכית על כיסוי הטנק. תכנון זה מתאים במיוחד למערכות משאבת עקירה קבועות -.
2) עליון - תחנה הידראולית אופקית רכובה: יחידת המשאבה מותקנת אופקית על כיסוי הטנק. תכנון זה משמש בעיקר במערכות משאבת עקירה משתנות- מכיוון שהוא מקל על בקרת זרימה.
3) צד - תחנה הידראולית המותקנת: יחידת המשאבה מותקנת אופקית על בסיס עצמאי ליד הטנק. תכנון זה מאפשר משאבת גיבוי ומתאים במיוחד למערכות עם יכולות מיכל העולות על 300 ליטר וכוח מנוע העולה על 7.5 קילוואט.

